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基金申請(qǐng)技巧講座第四軍醫(yī)大學(xué)科研部蘇景寬
第一部分 如何撰寫申請(qǐng)書
一、摘 要(限400字)包括:研究方法、內(nèi)容、目標(biāo)、科學(xué)意義。
采用改良的消減雜交技術(shù)建立老年性白內(nèi)障晶狀體上皮細(xì)胞差異表達(dá)基因文庫并制備基因芯片,利用此芯片篩選出白內(nèi)障相關(guān)基因。通過基因轉(zhuǎn)染在體和培養(yǎng)的晶狀體上皮細(xì)胞,觀察細(xì)胞的形態(tài)、增殖和凋亡、骨架蛋白及晶狀體蛋白的變化,研究基因的功能。從晶狀體上皮細(xì)胞的角度闡明老年性白內(nèi)障發(fā)生的分子生物學(xué)機(jī)制,為防治白內(nèi)障提供新思路和理論依據(jù)。
二、立論依據(jù)
對(duì)基礎(chǔ)研究,著重結(jié)合國(guó)際科學(xué)發(fā)展趨勢(shì),
論述科學(xué)意義
對(duì)應(yīng)用基礎(chǔ)研究,著重結(jié)合學(xué)科前沿,圍
繞國(guó)民經(jīng)濟(jì)和社會(huì)發(fā)展中的重要科技問題
論述應(yīng)用前景
在立論依據(jù)的闡述中,對(duì)研究領(lǐng)域、研究方向、 具體科學(xué)問題的理解 研究領(lǐng)域:白內(nèi)障的研究,包括發(fā)病機(jī)制、預(yù)防、診斷、 治療措施等研究 研究方向:白內(nèi)障發(fā)病機(jī)制的研究,包括環(huán)境因素、致病 靶點(diǎn)、細(xì)胞水平、分子水平研究等 科學(xué)問題:白內(nèi)障發(fā)病過程中的相關(guān)基因研究,包括致病 基因篩選、功能研究、調(diào)控機(jī)制、信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)等
1、項(xiàng)目的研究意義
存在問題:對(duì)科學(xué)意義的闡述不足或夸大
撰寫方法:
從領(lǐng)域入手,提出主要問題,引出熱點(diǎn)研究方向。
圍繞熱點(diǎn)研究方向進(jìn)行簡(jiǎn)要分析,找出目前尚未解決的具體科學(xué)問題,以此為切入點(diǎn)提出假設(shè),闡述如果解決了該問題(研究目標(biāo)),對(duì)該領(lǐng)域甚至相關(guān)領(lǐng)域的科學(xué)貢獻(xiàn)(理論意義或應(yīng)用前景)。
老年性白內(nèi)障是與年齡相關(guān)的疾病,隨著年齡的增
加,其發(fā)病比率也不斷升高。特別是人類趨向老齡化,
白內(nèi)障的患病人數(shù)還將持續(xù)增加。目前,它已是人類
第一位的致盲疾病。迄今為止, 治療白內(nèi)障唯一有效的
方法是通過手術(shù)摘除混濁的晶狀體并植入人工晶狀體。
雖然手術(shù)后患者可以恢復(fù)良好的視力,但是不可避免的
術(shù)后并發(fā)癥以及手術(shù)設(shè)備、材料耗資巨大,治療白內(nèi)障
所花費(fèi)的資金已成為世界各國(guó)包括富裕的發(fā)達(dá)國(guó)家嚴(yán)重
的醫(yī)療負(fù)擔(dān)。最近的調(diào)查表明,如果把老年性白內(nèi)障的
發(fā)病時(shí)間延緩10年,白內(nèi)障手術(shù)的數(shù)量就會(huì)減少45%[1]。
所以,一些學(xué)者認(rèn)為通過預(yù)防白內(nèi)障發(fā)生或延緩其發(fā)展
的途徑征服白內(nèi)障已成為一項(xiàng)全球性的社會(huì)和社會(huì)經(jīng)濟(jì)
問題[2]。
但是目前我們對(duì)老年性白內(nèi)障發(fā)病機(jī)理的認(rèn)識(shí)還不十分清楚。多年以來許多學(xué)者的研究結(jié)果證實(shí)晶狀體上皮細(xì)胞在老年性白內(nèi)障發(fā)生中起重要的作用,但對(duì)其中進(jìn)一步的基因調(diào)控知之甚少。如果從參與老年性白內(nèi)障晶狀體上皮細(xì)胞變化的相關(guān)基因入手,研究基因的生物學(xué)功能,有可能抓住引起白內(nèi)障發(fā)生、發(fā)展的主要環(huán)節(jié)。據(jù)此,本研究擬利用改良的消減雜交技術(shù)和基因芯片技術(shù)準(zhǔn)確、全面、快速的特點(diǎn),以晶狀體上皮細(xì)胞為研究對(duì)象,一次性篩選出老年性白內(nèi)障全部有差異表達(dá)的基因,從中再篩選出與白內(nèi)障相關(guān)基因,并著重對(duì)其功能進(jìn)行研究,從基因水平闡明白內(nèi)障的發(fā)病機(jī)制,為防治白內(nèi)障提供新思路和理論依據(jù)。
2、國(guó)內(nèi)外現(xiàn)狀分析(與綜述的區(qū)別)
存在問題:
A、低水平重復(fù):不了解最新進(jìn)展,對(duì)國(guó)內(nèi)外現(xiàn)
狀缺乏真正了解,提出的問題別人已解決。
B、文獻(xiàn)復(fù)習(xí)不全:檢索文獻(xiàn)方法不當(dāng)、選擇關(guān)鍵詞
不妥,甚至人為縮小檢索范圍。
C、總結(jié)表達(dá)不夠:對(duì)國(guó)內(nèi)外現(xiàn)狀缺乏歸納分析,
只是簡(jiǎn)單羅列,缺乏邏輯性和針對(duì)性。
D 、對(duì)方法原理理解不夠:對(duì)研究方法不熟悉,簡(jiǎn)
單移植或夸大其作用,缺乏實(shí)際應(yīng)用的可行性。
撰寫方法:要緊緊圍繞本次申請(qǐng)項(xiàng)目的主題。
A、從領(lǐng)域切入,簡(jiǎn)要論述國(guó)內(nèi)外研究成果,并引
出當(dāng)前的熱點(diǎn)研究方向。
B、從研究方向展開,較詳細(xì)地分析國(guó)內(nèi)外的研究
進(jìn)展,闡明在該方向上存在的問題。
C、圍繞存在的問題,結(jié)合國(guó)內(nèi)外以往的研究結(jié)果、
當(dāng)前的現(xiàn)狀及今后的發(fā)展趨勢(shì),詳細(xì)論述和分
析這些問題產(chǎn)生的原因,提出該方面的空白點(diǎn)、
未知數(shù)、以及研究的難點(diǎn)、焦點(diǎn),從而為自己
申請(qǐng)項(xiàng)目確立研究目標(biāo)奠定充分的立論基礎(chǔ)。
D、對(duì)擬采用的技術(shù)方法進(jìn)行介紹和分析。
成熟的方法重點(diǎn)介紹可以應(yīng)用于本研究的理論依據(jù)和實(shí)驗(yàn)依據(jù)。
新方法在詳細(xì)介紹其原理的基礎(chǔ)上,闡明可以應(yīng)用于本研究的理論依據(jù)和實(shí)驗(yàn)依據(jù)。
需特別注意的問題:必須對(duì)所運(yùn)用的技術(shù)方法的原理、流程尤其是在實(shí)際運(yùn)用中可能出現(xiàn)的問題要十分清楚,絕不能是一種簡(jiǎn)單的移植。
例如:抗體 + 功能基團(tuán),理論上可以實(shí)現(xiàn)融合,但存在“活性、表達(dá)載體選擇、純化等問題。
E、提出本項(xiàng)目的研究設(shè)想。
防治白內(nèi)障必須針對(duì)其發(fā)病的主要環(huán)節(jié)。多年以來,國(guó)內(nèi)外學(xué)者從不同的角度探討白內(nèi)障的發(fā)生機(jī)理。就致病的環(huán)境因素講,氧化因子、紫外線輻射、晶狀體周圍環(huán)境中離子濃度改變及一些生長(zhǎng)因子、細(xì)胞因子的改變均與老年性白內(nèi)障的發(fā)生有關(guān)。就研究的部位分,晶狀體中皮質(zhì)與核的蛋白質(zhì)改變及晶狀體纖維的改變與白內(nèi)障的形成有關(guān),而位于晶狀體前囊膜下單層的晶狀體上皮細(xì)胞在白內(nèi)障的形成中的變化更引人關(guān)注。
因?yàn)榫铙w上皮細(xì)胞是晶狀體中唯一有分裂活性、數(shù)量相對(duì)穩(wěn)定的細(xì)胞,它們分裂、分化出晶狀體纖維細(xì)胞、產(chǎn)生晶體蛋白,終生不停息,形成了晶狀體均一、對(duì)稱的結(jié)構(gòu),對(duì)維持晶狀體的透明起重要作用。不僅如此,晶狀體上皮細(xì)胞還是晶狀體中受外來刺激影響較早的部位,已有研究證實(shí)老年性白內(nèi)障的晶狀體上皮細(xì)胞還發(fā)生退行性變、細(xì)胞膜通透性增加、細(xì)胞內(nèi)酶活性改變、細(xì)胞數(shù)量減少、凋亡細(xì)胞增多等改變,與單純老化的晶狀體之間存在差異[3-5] 。
體外實(shí)驗(yàn)也證實(shí)多種因素(H2O2、UV-B、晶狀體蛋白的自身抗體)誘發(fā)的白內(nèi)障模型中晶狀體上皮的損傷是晶狀體混濁的主要環(huán)節(jié)[6-8]。因此,從晶狀體上皮細(xì)胞的變化入手探討白內(nèi)障的成因,有可能抓住揭示白內(nèi)障發(fā)病機(jī)理的主要環(huán)節(jié)。而晶狀體上皮細(xì)胞變化的基因調(diào)控機(jī)制是問題的關(guān)鍵所在,也是有待我們深入研究的問題。
白內(nèi)障的形成與晶狀體的老化密不可分,是晶狀體老化的極端表現(xiàn)。晶狀體的老化是多種因素相互作用的結(jié)果,包括基因的和非基因的隨機(jī)變化的不斷積累,也有程序性的、非隨機(jī)性的組織特異性多種基因表達(dá)的改變。目前,國(guó)內(nèi)外對(duì)白內(nèi)障相關(guān)基因的研究主要以下三方面:
一是對(duì)體外培養(yǎng)的晶狀體白內(nèi)障模型及上皮細(xì)胞的研究。UV-B輻射作用誘導(dǎo)的白內(nèi)障中晶狀體上皮細(xì)胞是主要的靶細(xì)胞,其Na-K-ATP酶的活性增加,蛋白質(zhì)的合成和分泌增加;上皮細(xì)胞的凋亡增加,其中有c-fos基因的表達(dá)增加;還有組蛋白H4、H3 的低表達(dá)`和蛋白酶C、β-肌動(dòng)蛋白、γ-肌動(dòng)蛋白基因的高表達(dá)[9-12]。Carper等[13]利用RT-PCR-DD(reverse transcription-polymerase chain reaction differential display)技術(shù)研究H2O2誘導(dǎo)的晶體上皮細(xì)胞的基因差異性表達(dá)結(jié)果顯示NADH脫氫酶4亞基、細(xì)胞色素b、谷氨酰胺轉(zhuǎn)移酶基因表達(dá)減少以及細(xì)胞因子的核蛋白、替代拼接因子2 (alternative splicing factor)、β-三羥基異丁酰輔酶A水解酶基因表達(dá)的增加。
二是利用轉(zhuǎn)基因動(dòng)物的研究。波形纖維蛋白基因(vimentin)、雜交的Ⅲ型中間纖維蛋白基因的轉(zhuǎn)基因小鼠表現(xiàn)出白內(nèi)障,而且有隨小鼠年齡增加白內(nèi)障加重的趨勢(shì)。晶狀體改變的共同特點(diǎn)是晶狀體纖維細(xì)胞分化受抑制[14,15]。Gong等[16]報(bào)告晶狀體的細(xì)胞膜蛋白連接蛋白α3(α3 Connexin)基因敲除小鼠(knockout mouse)在晶狀體形成的早期及纖維細(xì)胞分化早期不受影響,其后出現(xiàn)與晶狀體蛋白溶解有關(guān)的核性白內(nèi)障。
雖然體外實(shí)驗(yàn)和白內(nèi)障轉(zhuǎn)基因小鼠都提示我們一些基因的變化與白內(nèi)障有關(guān),但是,這些變化的基因是否與老年性白內(nèi)障形成有關(guān),目前尚缺乏進(jìn)一步的報(bào)告。
三是對(duì)人老年性白內(nèi)障晶體上皮的研究。Lee[17]利用RT-PCR技術(shù)研究顯示前極性白內(nèi)障與核性白內(nèi)障上皮細(xì)胞中纖維連接蛋白、I型膠原纖維、α-平滑肌蛋白、TGF-β1、TGF-β2、TGF-βⅡ型受體、結(jié)締組織生長(zhǎng)因子的基因表達(dá)有差異。Kantorow等[18]利用RT-PCR-DD研究老年性白內(nèi)障與正常晶狀體上皮的基因差異性表達(dá)的初步結(jié)果是老年性白內(nèi)障有三個(gè)高表達(dá)基因和12個(gè)低表達(dá)的基因。但就DD-PCR技術(shù)來講,在實(shí)驗(yàn)中難以解決假陰性、假陽性以及克隆全長(zhǎng)cDNA的問題。
上述三方面的研究均取得了不同程度的研究結(jié)果,但由于當(dāng)時(shí)技術(shù)條件的限制都未能全面闡明與白內(nèi)障相關(guān)的基因及其功能。
尋找白內(nèi)障時(shí)晶狀體上皮細(xì)胞與正常晶狀體上皮細(xì)胞間差異表達(dá)的基因有可能揭示白內(nèi)障的發(fā)病機(jī)理。
尋找差異表達(dá)基因的經(jīng)典方法是消減雜交技術(shù)(subtractive hybridization, SH),它是……,但是實(shí)驗(yàn)操作復(fù)雜。
經(jīng)過改進(jìn)后的抑制性消減雜交(suppression subtractive hybridization ,SSH是Diatchenko等1996年建立的方法)……簡(jiǎn)化了實(shí)驗(yàn)操作,但仍然問題很多。
我校生化教研室建立了改良消減雜交技術(shù)[19,20],其特點(diǎn)是:簡(jiǎn)便易行,能夠獲得目的細(xì)胞特異表達(dá)的全長(zhǎng)基因,對(duì)低豐度基因也能有效分離。
該方法的建立者已利用這一技術(shù)從脂多糖刺激前后的人牙髓細(xì)胞的差異表達(dá)的基因中克隆到脂多糖刺激后特異表達(dá)的基因,其中5個(gè)為新基因。同理,利用此方法也能快速、有效地獲得白內(nèi)障晶狀體上皮細(xì)胞與正常晶狀體上皮細(xì)胞間差異表達(dá)的基因,并克隆到全長(zhǎng)cDNA,為進(jìn)一步的結(jié)構(gòu)和功能研究打下基礎(chǔ)。
基因芯片技術(shù)的出現(xiàn),使檢測(cè)差異表達(dá)基因和未知DNA分子變得更快捷、準(zhǔn)確、高效;蛐酒窃1996年被提出并開始研制的,該技術(shù)是將成千上萬的DNA探針集中到1厘米見方的基片上,利用堿基互補(bǔ)原理,DNA探針中的已知堿基序列與被測(cè)定的未知DNA分子雜交后由標(biāo)記分子標(biāo)記雜交體,經(jīng)自動(dòng)閱讀設(shè)備分析雜交結(jié)果,從而對(duì)檢測(cè)基因進(jìn)行定性、定量和結(jié)構(gòu)分析,確定未知DNA分子。
由于目前尚沒有針對(duì)白內(nèi)障研究的現(xiàn)成基因芯片,根據(jù)本研究的需要,我們將篩選到的差異表達(dá)的所有基因建立cDNA文庫,再利用基因芯片技術(shù)制備成基因芯片,以此檢測(cè)多個(gè)樣本中白內(nèi)障晶狀體上皮細(xì)胞與正常晶狀體上皮細(xì)胞間差異表達(dá)的基因,從中進(jìn)一步篩選出白內(nèi)障特異的基因,它們中可能有已知基因,也可能有未知基因。通過以上兩種技術(shù)的有機(jī)結(jié)合,我們能更快捷、有效、準(zhǔn)確地得到白內(nèi)障相關(guān)基因。
綜上所述,分子生物學(xué)技術(shù)的發(fā)展為研究白內(nèi)障發(fā)生過程中的功能基因及特異調(diào)控基因提供了有利武器。本項(xiàng)目從晶狀體上皮細(xì)胞入手,利用改良的消減雜交技術(shù)和基因芯片技術(shù)系統(tǒng)研究與白內(nèi)障相關(guān)的基因,并采用對(duì)體外培養(yǎng)細(xì)胞和在體晶狀體上皮細(xì)胞的基因轉(zhuǎn)染,探討它們?cè)诰铙w上皮細(xì)胞變化和白內(nèi)障形成中的作用,可望闡明白內(nèi)障晶狀體上皮細(xì)胞變化的分子生物學(xué)機(jī)制,為防治白內(nèi)障提供新的思路和理論依據(jù)。
3、參考文獻(xiàn) A、文獻(xiàn)類別要全:以英文文獻(xiàn)為主,同時(shí)也要引用 中文文獻(xiàn)--- 國(guó)內(nèi)同行中知名專家的文獻(xiàn)。 B、引文信息要全:文章題目、作者姓名、具體出處 (包括期刊名、年份、卷期、頁碼等)。 C、文獻(xiàn)年代要新:主要是近五年的文獻(xiàn),最好能有 07年的最新文獻(xiàn)。
三、研究方案
1、研究目標(biāo)
撰寫要求: 有限目標(biāo),與研究?jī)?nèi)容相呼應(yīng)
2、研究?jī)?nèi)容:
存在問題:內(nèi)容過多,一個(gè)研究周期難以完成
內(nèi)容分散,不能集中闡明研究目標(biāo)
撰寫要求:內(nèi)容要適當(dāng)—確保研究周期內(nèi)完成
為目標(biāo)服務(wù)—與目標(biāo)相輔相成
要重點(diǎn)闡述—注意與技術(shù)路線區(qū)別
舉例:
(1)篩選白內(nèi)障相關(guān)基因:采用改良的消減雜交技術(shù),獲得人老年性白內(nèi)障晶狀體上皮細(xì)胞和正常晶狀體上皮細(xì)胞差異表達(dá)的基因片段,建立cDNA文庫。制備差異表達(dá)基因的基因芯片,利用基因芯片技術(shù)從多個(gè)標(biāo)本的老年性白內(nèi)障晶狀體上皮細(xì)胞中篩選出白內(nèi)障相關(guān)基因。
(2)研究白內(nèi)障相關(guān)基因的結(jié)構(gòu):……
(3)研究白內(nèi)障相關(guān)基因在晶狀體上皮細(xì)胞變化中的作用:……
觀察指標(biāo)如下:
①存活細(xì)胞數(shù);②光鏡、透射電鏡下細(xì)胞形態(tài)的變化;③細(xì)胞凋亡檢測(cè):用原位末端標(biāo)記和連接酶介導(dǎo)PCR方法,從形態(tài)和DNA水平分析細(xì)胞凋亡;④細(xì)胞增殖的檢測(cè):……;⑤細(xì)胞骨架蛋白的檢測(cè):……;⑥晶狀體蛋白的檢測(cè):
3、擬解決的關(guān)鍵問題:
存在問題:抓不住關(guān)鍵問題或抓得不準(zhǔn)。
什么是關(guān)鍵問題 ?
--研究過程中對(duì)達(dá)預(yù)期目標(biāo)有重要影響的某些研究
內(nèi)容或因素。
--為達(dá)預(yù)期目標(biāo)所必須掌握的關(guān)鍵技術(shù)或研究手段。
撰寫要求:找出關(guān)鍵問題,提出解決辦法。
舉例:
(1)建立差異表達(dá)的cDNA文庫:
建立差異cDNA文庫是篩選老年性白內(nèi)障相關(guān)基因的前提。為使差異cDNA文庫具有代表性,我們采取以下解決方案:
①選擇各種類型老年性白內(nèi)障晶狀體的前囊膜、取足夠大量的標(biāo)本(擬取50例標(biāo)本)作為建庫的mRNA的來源。
②利用改良的消減雜交技術(shù)可快速、有效地獲得差異表達(dá)的完整cDNA片段。此技術(shù)是本課題組成員主要的研究成果,在應(yīng)用此項(xiàng)技術(shù)中已積累了較豐富的實(shí)驗(yàn)經(jīng)驗(yàn)。
(2)制備基因芯片:
制備用于本研究的芯片是篩選老年性白內(nèi)障相關(guān)基因的關(guān)鍵環(huán)節(jié)。制備基因芯片的關(guān)鍵是在 1平方厘米的基片上放上成百上千的不同基因探針而不使它們發(fā)生任何混淆。在制作基因芯片時(shí)做到:①嚴(yán)格按操作程序進(jìn)行;②在標(biāo)本的處理及RNA提取時(shí)避免污染,否則即會(huì)造成嚴(yán)重的損失。只要嚴(yán)格按操作程序進(jìn)行操作就可以避免發(fā)生差錯(cuò)。
(3)在體基因轉(zhuǎn)染:
在體基因轉(zhuǎn)染是進(jìn)行白內(nèi)障相關(guān)基因功能研究的關(guān)鍵。在體的晶狀體上皮細(xì)胞大部分處在靜息狀態(tài),只有位于赤道前區(qū)的少量細(xì)胞具有分裂活性,而且晶狀體表面有一層膠原性質(zhì)的囊膜包裹。在體晶狀體的基因轉(zhuǎn)染的關(guān)鍵是如何使大量分裂后細(xì)胞轉(zhuǎn)染,如何使病毒穿過晶狀體的囊膜,針對(duì)以上問題我們擬采取下列方法解決:①選用反轉(zhuǎn)錄病毒的慢病毒載體( lentiviral vector ),它克服了一般反轉(zhuǎn)錄病毒只能轉(zhuǎn)染有分裂能力細(xì)胞的局限性,對(duì)分裂后細(xì)胞也能有效的轉(zhuǎn)染。這對(duì)在體晶狀體的基因轉(zhuǎn)染有很大的優(yōu)越性。②采用直徑1-2μm玻璃微管在顯微鏡下將病毒載體注入晶狀體的前囊膜下,既不破壞晶狀體的完整性,又可使病毒接觸到囊膜下的上皮細(xì)胞。
4、研究方法
存在問題:
過于簡(jiǎn)單:在方案中只有方法名稱而無具體步驟。
過于繁雜:大量羅列一些常規(guī)的實(shí)驗(yàn)方法。
撰寫要求:以研究項(xiàng)目的需求為前提,盡量采用最適合的方法和手段,并將其操作步驟和關(guān)鍵環(huán)節(jié)體現(xiàn)在技術(shù)路線當(dāng)中。
5、技術(shù)路線
存在問題: 不清楚,不詳細(xì),不可行。
撰寫要求: 清晰、詳細(xì)、注意邏輯性。
撰寫方法:
—以時(shí)間順序?yàn)橹骶設(shè)計(jì)技術(shù)路線
—以研究?jī)?nèi)容為主線設(shè)計(jì)技術(shù)路線
—分大小標(biāo)題,突出邏輯關(guān)系。
—詳細(xì)地寫清楚每個(gè)具體步驟。
(1)人晶狀體上皮細(xì)胞的獲得:老年性白內(nèi)障晶狀體上皮細(xì)胞取自白內(nèi)障患者手術(shù)中取出的前囊膜(晶狀體上皮細(xì)胞緊貼于前囊膜),直徑約5mm。正常晶狀體上皮細(xì)胞取自角膜移植供體眼的晶狀體,在顯微鏡下撕下前囊膜,直徑約8mm。按文獻(xiàn)提供的方法去除晶狀體纖維細(xì)胞,仔細(xì)清洗以去除血細(xì)胞污染。
(2)建立差異cDNA文庫:從50例白內(nèi)障手術(shù)患者的前囊膜上取下的晶狀體上皮細(xì)胞作為實(shí)驗(yàn)組,從25例正常晶狀體前囊膜上取下的晶狀體上皮細(xì)胞作為對(duì)照組,利用改良的消減雜交技術(shù)[19,20],獲得差異表達(dá)的cDNA,并建立文庫。主要的實(shí)驗(yàn)流程如下:
正常晶狀體上皮細(xì)胞 白內(nèi)障晶狀體上皮細(xì)胞
Promega PolyATtract® System 1000
mRNA分離 mRNA分離
oligo-dT18反轉(zhuǎn)錄 ntech Cap-finder方法反轉(zhuǎn)錄
cDNA
Biotin-21-dUTP pending-cDNA
隨機(jī)引物PCR
雜交
Sephacryl S-400柱
除鹽及小片段
鏈親和素-生物素磁性分離
除去雜交體及過量正常晶狀體上皮細(xì)胞cDNA
“長(zhǎng)距離”PCR
目的cDNA的特異擴(kuò)增
克隆、鑒定、轉(zhuǎn)化
建立差異基因文庫
(3)制備基因芯片篩選白內(nèi)障相關(guān)基因:
① 基因芯片的制備: ………
②白內(nèi)障相關(guān)基因的篩選:……
(4)白內(nèi)障相關(guān)基因的結(jié)構(gòu)分析:
① 序列測(cè)定:... ...
② 序列的計(jì)算機(jī)分析: ... ...
③ 獲得全長(zhǎng)基因: ... ...
(5)基因轉(zhuǎn)染:
① 培養(yǎng)人晶狀體上皮細(xì)胞的轉(zhuǎn)染:……
② 在體晶狀體的轉(zhuǎn)染:……
6、可行性分析
對(duì)實(shí)驗(yàn)方案設(shè)計(jì)的分析
理論分析
研究手段方法分析
預(yù)實(shí)驗(yàn)結(jié)果分析
對(duì)相關(guān)條件的分析
所用特殊實(shí)驗(yàn)材料(試劑)的分析
對(duì)所具備的實(shí)驗(yàn)條件進(jìn)行分析
對(duì)項(xiàng)目組成員搭配及其運(yùn)用技術(shù)方法的能力分析
(1)關(guān)于建立差異cDNA文庫:
老年性白內(nèi)障晶狀體上皮細(xì)胞與正常晶狀體上皮細(xì)胞是處在不同狀態(tài)下的細(xì)胞,細(xì)胞基因表達(dá)的改變
是細(xì)胞蛋白功能等改變的基礎(chǔ)。尋找這些有差異的基
因是探索細(xì)胞功能、狀態(tài)變化原因的突破口。利用的
消減雜交技術(shù)是篩選差異表達(dá)基因的有效方法。改良
的消減雜交技術(shù)是我們研究組成員建立的方法,應(yīng)用
此方法已經(jīng)從脂多糖刺激前后的人牙髓細(xì)胞的差異表
達(dá)的基因中克隆到脂多糖刺激后特異表達(dá)的基因,其
中 5個(gè)為新基因,這一研究成果進(jìn)一步證實(shí)了該方法
的可操作性,而且我們?cè)谶\(yùn)用此方法過程中也積累了
較豐富的經(jīng)驗(yàn),因此,本研究利用這一方法從兩種狀
態(tài)的晶狀體上皮細(xì)胞中篩選差異表達(dá)的基因并建立
cDNA文庫是可行的。
7、創(chuàng)新性
存在問題: 對(duì)創(chuàng)新點(diǎn)提煉不夠
把運(yùn)用新技術(shù)、新方法理解為創(chuàng)新
與研究目標(biāo)、研究?jī)?nèi)容相混淆
對(duì)創(chuàng)新的理解:
原始創(chuàng)新:填補(bǔ)空白或修改傳統(tǒng)的理論
發(fā)明創(chuàng)造新技術(shù)、新方法
跟蹤創(chuàng)新:補(bǔ)充、完善現(xiàn)有理論
修改、完善現(xiàn)有技術(shù)方法(1+1>2)
提煉方法:用逆向思維方法提煉創(chuàng)新點(diǎn)
(1)基因篩選方法上的創(chuàng)新:
首次采用改良的消減雜交技術(shù)建立白內(nèi)障晶狀體上皮細(xì)胞差異表達(dá)基因文庫,并制備相應(yīng)的基因芯片,利用此基因芯片篩選出老年性白內(nèi)障相關(guān)基因。上述兩種方法的有機(jī)結(jié)合使我們能快速、準(zhǔn)確、定性、定量地獲得多個(gè)白內(nèi)障相關(guān)基因。通過分析這些基因的結(jié)構(gòu)、研究它們的功能,揭示老年性白內(nèi)障晶狀體上皮細(xì)胞變化的分子生物學(xué)機(jī)制,為防治白內(nèi)障提供新的思路。
(2)基因功能研究上的創(chuàng)新:......
(1)有關(guān)消減雜交技術(shù)和基因芯片技術(shù)的工作基礎(chǔ):
本研究所用的基因篩選技術(shù)主要是改良的消減雜交技術(shù),此技術(shù)是我們研究組成員主要參與建立的,并利用此技術(shù)從脂多糖刺激前后的人牙髓細(xì)胞的差異表達(dá)的基因中克隆到脂多糖刺激后特異表達(dá)的基因,其中5個(gè)為新基因,有關(guān)此技術(shù)的研究論文有:......
(2)有關(guān)基因轉(zhuǎn)染方面的研究工作基礎(chǔ):......
(3)有關(guān)老年性白內(nèi)障相關(guān)基因的研究基礎(chǔ):......
2、工作條件 實(shí)驗(yàn)室整體實(shí)力和規(guī)模(地位、課題、成果等) 實(shí)驗(yàn)室所具備的與申請(qǐng)項(xiàng)目相關(guān)的主要儀器設(shè)備 實(shí)驗(yàn)室所在單位具備的申請(qǐng)項(xiàng)目所需的實(shí)驗(yàn)條件 3、項(xiàng)目組人員簡(jiǎn)歷 所有人員均需介紹(重點(diǎn)是項(xiàng)目負(fù)責(zé)人) 介紹內(nèi)容根據(jù)在項(xiàng)目中的分工有所側(cè)重 列出與申請(qǐng)項(xiàng)目相關(guān)的研究論文及成果
第二部分撰寫申請(qǐng)書時(shí)常見問題解析
1、對(duì)立論依據(jù)、實(shí)驗(yàn)方案、研究基礎(chǔ)應(yīng)闡述的內(nèi)容 以及三者關(guān)系的理解 立論依據(jù):闡述背景和理由,回答“為什么” 實(shí)驗(yàn)方案:是申請(qǐng)書的核心,回答“怎么做” 研究基礎(chǔ):展示積累和實(shí)力,回答“做了啥”
2、對(duì)研究目標(biāo)的確定 國(guó)內(nèi)外現(xiàn)狀分析中提出的具體科學(xué)問題就是項(xiàng)目的研究目標(biāo),研究目標(biāo)具體到什么程度,要根據(jù)研究周期、資助強(qiáng)度來確定。
3、研究目標(biāo)、研究?jī)?nèi)容、研究方法的關(guān)系 依據(jù)目標(biāo)確定研究?jī)?nèi)容 根據(jù)內(nèi)容選擇研究方法
5、對(duì)擬解決的關(guān)鍵問題與可行性分析撰寫時(shí)的區(qū)別
二者相同之處:擬解決的關(guān)鍵問題在可行性分析時(shí)也要提及
二者不同之處:
撰寫擬解決關(guān)鍵問題,重點(diǎn)回答如何解決。
解決辦法包括:通過研究思路的設(shè)計(jì)巧妙
運(yùn)用最新出現(xiàn)的研究方法
通過不同方法各自優(yōu)點(diǎn)的有機(jī)結(jié)合
在進(jìn)行可行性分析時(shí),重點(diǎn)回答能夠解決。
分析問題角度:通過對(duì)現(xiàn)有理論分析提供理論依據(jù)
通過對(duì)預(yù)研結(jié)果分析提供實(shí)驗(yàn)依據(jù)
通過對(duì)他人研究成果描述提供佐證
6、創(chuàng)新點(diǎn)、研究目標(biāo)和預(yù)期研究結(jié)果的區(qū)別
三者的共同點(diǎn):都包含一個(gè)“新”字。
三者的不同點(diǎn):概念的外延不同。
創(chuàng) 新 點(diǎn): ① 形態(tài)學(xué)證實(shí)在腦下垂體中確有神經(jīng)纖維存在
② 進(jìn)一步實(shí)驗(yàn)證實(shí)是肽能神經(jīng)
研究目標(biāo):通過各種形態(tài)學(xué)研究充分證明在腦下垂體中確
有肽能神經(jīng)支配
預(yù)期研究結(jié)果:提出腦下垂體肽能神經(jīng)和體液雙重調(diào)節(jié)
假說,對(duì)原有理論提出挑戰(zhàn)。
二、尚需注意的幾個(gè)問題
1、在項(xiàng)目設(shè)計(jì)過程中要樹立整體觀念,要
講述一個(gè)完整的故事。
2、文字表達(dá)要精雕細(xì)琢,每一句話說明什么
要做到心中有數(shù)。
3、文獻(xiàn)回顧不能回避國(guó)內(nèi)外最新研究進(jìn)展,
尤其是不同學(xué)派的觀點(diǎn)。
4、重點(diǎn)內(nèi)容、觀點(diǎn)要用黑體強(qiáng)調(diào)。
第三部分基金申報(bào)相關(guān)規(guī)定及要求
一、 基金申報(bào)管理規(guī)定
申請(qǐng)者基本資格:項(xiàng)目的實(shí)際負(fù)責(zé)人;正式受聘,年工作不少于六月;在職研究生只可申請(qǐng)面上項(xiàng)目
限項(xiàng)規(guī)定:高級(jí)專業(yè)技術(shù)職務(wù)的科技工作者申請(qǐng)與承擔(dān)(含參加)面上、重點(diǎn)、重大等類別基金項(xiàng)目的數(shù)量(不包括執(zhí)行期一年及在一年以內(nèi)的基金項(xiàng)目)累計(jì)不得超過三項(xiàng)
面上項(xiàng)目管理辦法
面上項(xiàng)目包括自由申請(qǐng)項(xiàng)目、青年科學(xué)基金項(xiàng)目和地區(qū)科學(xué)基金項(xiàng)目,資助期限一般為三年
面上項(xiàng)目的申請(qǐng)采取集中受理方式
申請(qǐng)者須符合《規(guī)定》要求,并具有高級(jí)專業(yè)技術(shù)職務(wù)或已獲得博士學(xué)位。具有中級(jí)專業(yè)技術(shù)職務(wù)但未獲得博士學(xué)位的研究人員,經(jīng)兩名具有高級(jí)專業(yè)技術(shù)職務(wù)的同行專家推薦,亦可申請(qǐng)。在職研究生作為申請(qǐng)者須征得導(dǎo)師同意
青年科學(xué)基金項(xiàng)目的申請(qǐng)者限在受理申請(qǐng)當(dāng)年1月1日未滿35周歲,并且未曾獲得該類項(xiàng)目的資助
申請(qǐng)者同期只能申請(qǐng)一項(xiàng),每個(gè)項(xiàng)目的申請(qǐng)者限為一人。申請(qǐng)者和具有高級(jí)專業(yè)技術(shù)職務(wù)的項(xiàng)目組主要成員,當(dāng)年申請(qǐng)及承擔(dān)(含參加)在研的面上項(xiàng)目數(shù)合計(jì)不得超過兩項(xiàng)。不具有高級(jí)專業(yè)技術(shù)職務(wù)的申請(qǐng)者,當(dāng)年申請(qǐng)及負(fù)責(zé)在研的面上項(xiàng)目數(shù)合計(jì)不得超過一項(xiàng),但參加項(xiàng)數(shù)不限
研究經(jīng)費(fèi)是指直接用于科學(xué)研究的費(fèi)用。
科研業(yè)務(wù)費(fèi):測(cè)試計(jì)算分析費(fèi),動(dòng)力能源費(fèi),差旅費(fèi),調(diào)研和學(xué)術(shù)會(huì)議費(fèi),資料、論文版面費(fèi)和印刷費(fèi),文獻(xiàn)檢索、入網(wǎng)等信息通訊費(fèi),學(xué)術(shù)刊物訂閱費(fèi)
實(shí)驗(yàn)材料費(fèi):原材料、試劑、藥品等消耗品購置費(fèi),實(shí)驗(yàn)動(dòng)物、植物的購置、種植、養(yǎng)殖費(fèi),標(biāo)本、樣品的采集加工費(fèi)和包裝運(yùn)輸費(fèi)
儀器設(shè)備費(fèi):專用儀器設(shè)備購置、運(yùn)輸、安裝費(fèi)和修理費(fèi),自制專用儀器設(shè)備的材料、配件購置費(fèi)和加工費(fèi)
實(shí)驗(yàn)室改裝費(fèi):不得用于實(shí)驗(yàn)室擴(kuò)建、土建、房屋維修等費(fèi)用的開支
協(xié)作費(fèi):外單位協(xié)作承擔(dān)自然科學(xué)基金項(xiàng)目部分研究試驗(yàn)工作的費(fèi)用
國(guó)際合作與交流經(jīng)費(fèi):直接關(guān)系的國(guó)際合作與交流費(fèi)用,包括項(xiàng)目組人員出訪及外國(guó)專家來訪的部分費(fèi)用
勞務(wù)費(fèi):用于直接參加項(xiàng)目研究的研究生、博士后人員的勞務(wù)費(fèi)用
管理費(fèi):項(xiàng)目依托單位為組織和支持項(xiàng)目研究而支出的費(fèi)用,包括項(xiàng)目執(zhí)行中公用儀器設(shè)備、房屋占用費(fèi)等
二、2007版申請(qǐng)書注意事項(xiàng)
建議正文編輯方式
使用 Word 錄入、編輯和排版需要錄入的申請(qǐng)書正文部分內(nèi)容。完成編輯后,將該文件命名保存
打開申請(qǐng)書文件,光標(biāo)定位在正文中需要插入內(nèi)容的位置
選擇 “插入”下拉菜單中的“文件”插入功能,選擇包含申請(qǐng)書正文內(nèi)容的文件,將其內(nèi)容全部導(dǎo)入到申請(qǐng)書中(不要使用剪貼板功能進(jìn)行文件內(nèi)容導(dǎo)入)
2007年面上項(xiàng)目申請(qǐng)資助經(jīng)費(fèi)
30萬元/項(xiàng)
形式審查要點(diǎn):12個(gè)確認(rèn)
確認(rèn)項(xiàng)目負(fù)責(zé)人申報(bào)資格
確認(rèn)申請(qǐng)書為2007版
確認(rèn)提交和打印電子文檔時(shí)已“檢查保護(hù)”
確認(rèn)電子版的版本號(hào)與紙質(zhì)文件完全一致
確認(rèn)申報(bào)學(xué)科選擇正確,項(xiàng)目信息填報(bào)完整無誤
確認(rèn)項(xiàng)目負(fù)責(zé)人和項(xiàng)目組成員親自簽字
形式審查要點(diǎn):12個(gè)確認(rèn)
確認(rèn)參與多個(gè)項(xiàng)目的人員身份和提法一致
確認(rèn)項(xiàng)目組成員統(tǒng)計(jì)人數(shù)與填報(bào)人數(shù)一致
確認(rèn)正文中流程圖及插入圖片位置、形式正確
確認(rèn)電子郵箱暢通,以便及時(shí)查閱郵件
確認(rèn)所有附件材料完整并已經(jīng)盡量電子化
確認(rèn)A3紙雙面套印,蓋章頁放在最后
謝 謝!
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